La Fiscalía ha impugnado la totalidad de la investigación del juez Juan Carlos Peinado contra Begoña Gómez, esposa del presidente del Gobierno, y el resto de imputados. El fiscal José Manuel San Baldomero afirma que la investigación no se basa en hechos concretos ni en pruebas o indicios reales y objetivos. La investigación se centra en la actividad de Begoña Gómez en la Universidad Complutense y sus relaciones con el empresario Juan Carlos Barrabés. El fiscal considera que no hay ánimo de lucro en la actuación de Gómez y que el software desarrollado perseguía el desarrollo de una plataforma gratuita para pymes y ONG. La Fiscalía también se refiere a la acusación de intrusismo profesional contra Gómez, pero considera que no se da el componente doloso necesario para acusar de un delito. El juez Peinado había decidido derivar la pieza principal de la investigación a un tribunal del jurado, lo que ha sido impugnado por el fiscal. La investigación se inició tras una querella presentada por Manos Limpias y ha sido ampliada con acusaciones populares, algunas vinculadas a la extrema derecha. El fiscal concluye que no hay elemento probatorio de respaldo a pesar de la exhaustiva indagación realizada hasta el momento. El 23 de septiembre, el juez había tomado una decisión similar con la pieza separada en la que investiga las tareas realizadas por la asesora de la Moncloa que gestiona la agenda de Begoña Gómez.